Проще оформить стройпаспорт на реконструкцию. Проект потом потянет за собой кучу дополнительной мороки при оформлении разрешения на начало работ.
При этом нужно иметь в виду, что в конце строительства придется показать БТИшникам "старые стены", часть оставшегося старого здания. Т.е., даже если все стены будут новыми, они должны располагаться на месте старых, должна быть возможность выдать их за часть старого дома. Иначе в конце столкнетесь с тем, что оформленные на реконструкцию д-ты не подходят. А вообще - я бы тоже посоветовала сюда
http://www.stroimdom.com.ua - очень грамотные товарищи и друзья по "счастью". Получите советы на все случаи строительной жизни!