Все семена вряд ли были заражены вирусом. По крайней мере, в моей многолетней практике и выращивании одновременно около 40-ка сортов томатов такого не наблюдала

Потому предполагаю, что причиной могли стать повреждения кустов цикадками, может тля. На моем участке кусты томатов заражают вирусом цикадки. Почитайте эту ссылку и попробуйте придерживаться этих советов :
http://agrosovet.com.ua/arhiv/35-01-...-17-03-13.html