Оксан, сейчас, если хочешь и есть время и желание, топинамбур можешь подрезать, но не полностью или вообще не трогать до весны. Ничего с ним не случится, одно из самых жизнестойких. Пока не ударили морозы, полезные вещества переходят в клубни. А в земле они прекрасно сохраняются до весны ничего не теряя. Выдерживают температуру и -30С и до -40С, кажется.
Выкапывать сейчас урожай не нужно. Постепенно. Можно даже зимой, если земля сильно не промерзнет. А оставленные стволы будут метками...