Садовник, larissa, благодарю за советы.
Под корой этого дерева видел жуков 2мм длиной, судя по виду,
плодовый заболонник http://www.sadurad.ru/bolezny_zabolon_plod.htm а также белых и розовых личинок. На соседних деревьях нашел немного таких же маленьких дырочек, диаметр 1-2мм, неглубокие - несколько мм. После сбора яблок обработаю препаратом "Актара". Гусеницы древоточца, судя по описанию, должны были оставить намного более широкие и глубокие ходы, а тут маленькие, может это не он?